タブで開く設定。

$ defaults write com.apple.Safari TargetedClicksCreateTabs -bool true

ウインドウで開く設定。

$ defaults write com.apple.Safari TargetedClicksCreateTabs -bool false
via
  • Safariのタブで開いて欲しいリンクが新規ウィンドウで開かれてしまう問題を解決する - Macの手書き説明書